题目:High-resolution Hi-C maps highlight multiscale 3D epigenome reprogramming during pancreatic cancer metastasis
译名:高分辨率Hi-C揭示在胰腺癌转移过程中的3D表观重塑
杂志:J Hematol Oncol
影响因子:17.381
发表时间:2021
主要技术:Hi-C,ChIP-seq,RNA-seq,ATAC-seq
样本选择:正常胰腺上皮细胞系,原发胰腺癌细胞系,转移胰腺癌细胞系
主要结果:
1)研究者发现在转移的胰腺癌细胞中,其compartment,contact domains与loop都发生了显著的变化,同时其基因组的表观状态也发生了改变
2)研究者发现在compartment变化区域、contact domain变化区域以及转移胰腺癌特异的enhancer-promoter loop中上调的基因,与癌症的转移及病人的预后不良相关
3)研究者发现参与形成转移肿瘤特异的enhancer-promoter loop的转录因子与肿瘤转移相关
4)研究者发现LIPC,可能启动肿瘤转移,该基因通过与肿瘤转移特异的enhancer形成loop
图1. 多组学数据分析揭示胰腺癌转移过程中的3D表观重塑相关关键基因流程图
图2. Contact domain改变伴随表观基因组的状态改变例图