泛基因组测序(Pan-genome)
泛基因组(Pan-genome)即某一物种全部基因的总称，这里这个全部基因是有别于个体基因组的基因的。一个个体的基因组是这个物种基因组的代表。因此，以一个基因组为模板的分析不能全面的反应物种基因水平的全部遗传信息，尤其是在研究同一物种中差异巨大的不同亚种或者变种，此类特有片段的差异往往要比共有片段中的差异更为重要。分析核心基因和非核心基因的基本情况，并从特有基因序列的角度来研究物种内的差异。
分析内容：
（1）不同亚种的材料：可以研究物种的起源及演化等重要生物学问题
（2）野生种和栽培种等不同特性的种质资源：可以发掘重要性状相关的基因资源，为科学育种提供指导
（3）不同生态地理类型的种质资源：可以开展物种的适应性进化，外来物种入侵性等热门科学问题的研究，为分子生态学等学科提供新的研究手段
测序参数
一般采用二代+三代的测序策略，根据组装目的一般建议一下策略：
泛基因组分析内容
