Hi-C解析新月柄杆菌三维构象
文章题目:High-Resolution Mapping of the Spatial Organization of a Bacterial Chromosome
发表杂志及时间:Science,2013
研究者在初次经Hi-C解析新月柄杆菌三维基因组后,为研究基因转录表达在染色体结构中的作用,对新月柄杆菌进行了利福平(可抑制转录延伸)处理并构建其全基因组互作图谱。
经分析发现,与野生型菌株的互作图谱相比(no treatment),利福平处理菌株的全基因组互作图谱中(+rifampicin)可以明显看到CID结构消失,形成没有domain限制的组织构象。这些结果表明,经过利福平处理,新月柄杆菌转录被抑制,其转录单元CID发生了破坏,局部三维结构发生了变化(Fig 2)。
Figure 2 转录抑制对三维结构的影响
Figure 3 高表达基因对三维结构的影响
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