原文题目： Comparative analysis of long noncoding RNAs in angiosperms and characterization of long noncoding RNAs in response to heat stress in Chinese cabbage
杂志信息：Horticulture Research，2021（IF：6.7）
样品选择：不同热处理阶段的大白菜
测序策略：lncRNA测序+mRNA测序
重要意义：通过鉴定参与大白菜高温胁迫相关的lncRNA及其靶基因，为全面理解白菜耐热机理，特别是lncRNA介导的基因调节机理提供了理论基础
主要内容和结论：
· 该研究以大白菜基因组测序材料‘Chiifu-401-42’为试材，对不同热处理阶段的大白菜进行lncRNA测序，共鉴定得到了1229个响应热胁迫的lncRNA
· 随着热处理时间的延长，响应热胁迫的lncRNA数目逐渐增加，且在各个处理阶段上调表达的lncRNA数目均多于下调表达的lncRNA
· 对这些热响应的lncRNA进行全基因组靶基因预测发现，445个lncRNA可通过反式作用调节1544个基因的表达，1027个lncRNA可顺式调节2651个基因
· 这些靶基因在“内质网蛋白加工”和“植物激素信号转导”途径中显著丰富。其中，29和22个lncRNA分别参与调控热响应蛋白HSP和ABA受体PYL基因的表达
大白菜 LncRNA及其反式调控mRNA之间的相互作用
