文章题目:MeRIP-seq 和 RNA-seq的联合分析解析急性髓系白血病致癌机制
原文题目:FTO plays on oncogenic Role in acute myeloid leukemia as a N6-methyladenosine RNA demethylase
期刊及发表时间:cancer cell,2017
主要内容:
FTO作为一个m6A去甲基化酶,在急性髓系白血病(AML)中发挥重要的致癌作用。FTO在t(11q23)/ MLL-重排、t(15;17)/PML-RARA、FLT3-ITD和NPM1突变的AMLs中高表达。
FTO可以增强白血病癌基因介导的细胞转化和白血病发生,通过降低这些mRNA转录物中的m6A水平来调节靶基因的表达,如ASB2和RARA,从而抑制全反式维甲酸(ATRA)诱导的AML细胞分化。
案例2:
中文题目:MeRIP-seq 和 RNA-seq以及蛋白质组学的联合分析解析
原文题目:Refined RIP-seqprotocalfor epitranscriptomeanalysis with low input materials
期刊及发表时间:PLOS,2018
主要内容:
对2个肺腺癌患者肿瘤的m6A数据、RNA-seq数据和MS数据进行联合分析,确定了18个m6A水平存在差异、mRNA和蛋白水平变化不一致的基因。在肿瘤1中,与ACOT2、PARP9、ALG2和SLC2A1等多个基因的蛋白水平相比,其蛋白水平显著上调。同时发现肿瘤2中一些基因的蛋白质水平,如MYL9、VIM和CST3,相对于mRNA水平显著下调,所以m6A修饰在很大程度上可以解释mRNA和蛋白质水平之间的不一致性,是值得进一步探索的研究方向。